С сайта самого зоопарка:

На 1 января 1941 г. Аквариум-Зоосад насчитывал 135 видов животных: млекопитающих 27 видов, птиц 37, пресмыкающихся 8, рыб 62. 16 августа 1941 г. в город вошли немецко-фашистские войска. Зоопарк не был эвакуирован.
Все годы оккупации зоосад был открыт для посетителей. В сентябре 1942 г. в зоосаде работало 24 человека с месячным фондом зарплаты 8505 крб.
В музее зоопарка хранятся подлинные входные билеты того времени, напечатанные на украинском и немецком языках, достоинством 50 коп. и 1 крб. Также в музее есть книга отзывов посетителей с 1937 по 1952 г. К сожалению, три листа периода войны из нее изъяты.
Во время отступления фашисты застрелили медведей и львов. Вот что пишет в своих воспоминаниях Л.Е. Ничикова: "…Некоторых животных нам удалось спрятать в подвальном помещении и замаскировать вход. На территорию зоопарка сыпались осколки от взрывов на заводе, раздавался гул от бомбежки. В калитку то и дело стучали немцы и полицаи. Немцы предлагали нам уходить, т.к. собирались заминировать зоопарк. К счастью, зоопарк не заминировали, мы оставались на своем посту..."
После освобождения города 29 марта 1944 г., в книге отзывов на второй день появилась первая запись: "В освобожденном Николаеве впервые нам пришлось посетить Николаевский Аквариум-Зоосад. Первыми вошли воинская часть №251. Множество уничтожено немецкими захватчиками. Остались одни пустые клетки. Сохранились крокодилы, золотые рыбки, павлины и еще ряд, что, конечно, нас и этим удовлетворило в виду разрушения. В аквариумах застыла вода. Золотые рыбы плавают подо льдом. От Н-ской части командир взвода Чучков".